De Mariakerk is de grootste en belangrijkste kerk van Rostock en wordt voor het eerst genoemd in een document uit 1232. Het dwarsschip en het schip van de kruisvormige basiliek zijn even lang en benadrukken de massieve en gesloten indruk. De kerk heeft waardevol meubilair, zoals de oudste astronomische klok in Noord-Duitsland uit 1472 en een bronzen doopvont uit 1290.
De oorsprong van St Mary's Church is gehuld in mysterie. De eerste gedocumenteerde vermelding van een predikant in St Mary's dateert uit 1232. Het eerste kerkgebouw van St. Mary's was een vroeggotische hallenkerk met een gewelfhoogte van ongeveer 15 meter en een eenvoudig zadeldak, waarvan de muurverbinding vandaag de dag nog te zien is aan de oostkant van de kerktoren.
Nadat de Mariakerk in 1265 tot hoofdkerk van de stad Rostock werd benoemd, voldeed dit gebouw op de lange termijn niet meer aan de behoeften van de burgers. Dus werd in 1290 begonnen met de verbouwing tot een basiliek naar het voorbeeld van de Mariakerk in Lübeck. De bouw duurde meer dan honderd jaar. De kerk heeft zijn huidige vorm sinds 1440 en de toren sinds 1796.
Mary's was een universiteitskerk tot het begin van de 19e en 20e eeuw. Borden in de kramen van de professoren verwijzen hier nog steeds naar. Sinds enkele jaren vindt de ceremoniële intrede van nieuwe studenten plaats in St. Mary's rond de opening van de universiteit.
De uitgebreide kerkbibliotheek van St. Mary's werd toen overgebracht naar de universiteitsbibliotheek.
Een bijzondere bezienswaardigheid is de astronomische klok. Deze werd in 1472 gemaakt door de klokkenmaker Hans Düringer en het hoofduurwerk bevat nog steeds de originele onderdelen uit die tijd. Zowel het hoofduurwerk en het kalenderuurwerk als het carillon, de apostelklok en de uurslag worden elke dag met de hand opgewonden. In 1642 werd de klok uitgebreid met het carillon, de apostelgalerij en de sierlijke renaissancekast. Helemaal bovenin bewegen zes figuren (evangelisten en apostelen) zich elke dag om 12.00 uur en middernacht langs de Christus die in het midden staat en hen zegent in een plechtige processie op een prominent platform. Het carillon klinkt elk uur op het hele uur.
