Den nygotiske kirke i Warnemünde blev indviet i 1871.
I 1866 påbegyndtes opførelsen af den nuværende kirke. Den nye bygning, der blev tegnet af landarkitekt Krüger (Schwerin) og opført af landarkitekt Wachenhusen (Rostock), blev dengang rejst i den vestlige udkant af byen, men ligger i dag midt i byen. Selvom kirken er forholdsvis ung, er den udsmykket med betydningsfulde udsmykningsgenstande, der blev overtaget fra den tidligere bygning.
Det gotiske udskårne alter er værket af en ukendt mester fra Danzig fra før år 1475. Statuetten af Sankt Kristoffer (græsk: christos, pherein: »Kristusbærer«) med Kristusbarnet på skulderen stammer omtrent fra samme tid som alteret. Et over 300 år gammelt urværk har siden maj 2007 stået i kirkens nordfløj.
Blandt de genstande, der er bevaret fra den gamle kirke i Warnemünde, findes også de husmærker, der dengang var fastgjort til kirkebænkene der – omkring 60 trædele.Delvist skjult i græsset foran kirkens østkor ligger en stenplade på 2,65 x 1,70 meter, som formodentlig lå på fortovet til præstegården i det 19. århundrede.
Besøgende i Warnemünder-kirken vil lægge mærke til to genstande, som man ikke finder i mange kirker. I sideskibene kan man se to votivskibe, som er blevet skænket til menigheden af de to lodskommandører Davids og Jantzen fra Warnemünde. Orgelet, der blev bygget i 1975 af firmaet Voigt fra Bad Liebenwerda, lyder under gudstjenester og koncerter.
