De kerk in Karlshagen is de enige nieuwe kerk die in de 20e eeuw op het eiland Usedom is gebouwd, afgezien van de kerk in Bansin.
Vanwege het groeiende aantal inwoners en vakantiegasten bouwde en wijdde Karlshagen in 1912 een eigen kerk. Tijdens de Tweede Wereldoorlog werd Peenemünde in de nacht van 17 op 18 augustus 1943 gebombardeerd. De kerk, die verwoest en uitgebrand was, werd in 1953 herbouwd dankzij een geldinzameling van pastoor Adolf Spreemann uit Karlshagen. In 1991 werd de kerk volledig gerenoveerd. Tegenwoordig wordt de kerk op verschillende manieren gebruikt als zaalkerk.